东京及纽约连续发生了两次由“Wizard”病毒引发的爆炸案件。这一病毒的设计者化名为蛯名舞子（由栗山千明饰演），她是被众人誉为天才少女的小圆的真实身份，并且曾是ARATA（由中居正广饰演）的老友。然而，在此紧要关头，美国联邦调查局(FBI)却急召ARATA参与其中，随即联合成立了跨国家和地区的情报中心。日本警察厅亦立刻组建了专案小组，优雅果敢的新任组长星秋穂（由松雪泰子饰演）亲自主持全局行动。针对有重大嫌疑的目标人物，小圆进行了精密追踪并企图施以制裁。与此同时，尽管已经辞职自立门户成为私家侦探多年，他那令人难以捉摸的智慧依然令两国执法机构感到困惑不已。此刻，ARATA、舞子以及川崎润介（由北村一辉饰演）组成的铁三角组合再次聚首，三人能否合作战胜这个前所未有的强大敌人。