在首集结尾时，于X教授带领下，变异人团体将万磁王隔离在外，但仍未赢得外部社会的信任。随后发生的一位关键政治家遭到暗杀后，对变异群体再次产生怀疑情绪。这一悲剧使X教授面临极大挑战，以至于不得不与总统对话以应对局面。先前备受尊敬的一个退役将领组建了一支反对变种人的武装力量并持续给X教授制造麻烦。为了化解当前紧张局势，万磁王决定尝试与X教授联手对付这名退役将领。与此同时，本剧还会进一步探索金刚狼的真实背景故事。