故事设定在公元2257年，当时人类已超越光速限制，展开了广泛的星际探险，在边缘地带建立了众多定居点，并与其他外星种族进行了交往和贸易往来。一日，隶属于地球联盟的一支星际巡查舰队在未知名区域进行任务过程中发现了一艘来源不明的空间飞船。由于误解对方的目的，这支地球军舰首次发起了攻击性行为。实际上那是由名为明巴利（Minbari）的一个先进生物体驾驶而来，他们的技术水平远远超出人类，且经历了漫长的时间进化期。不幸的是，在毫无保留的打击下，地球舰队误杀掉了灰议会领袖杜赫（Dharken）。事实上这位领导人之前就意识到应当按照宏伟的设计方案引导两种族和谐共存，此次访问正是这种初步接触的一部分。这导致了一场全规模报复性的战争爆发，战斗迅速升级直至最终消灭了地球本土目标。就在看似即将取得胜利之时，出乎所有人的预料——明巴利方面突然停火并且向地球提出友好提议。通过协商之后，各方决定在一个中立位置建立一个以“巴比伦五号”命名的空间站来促进跨星球信息共享以及长久的合作关系基础建设。尽管后续类似的设施都遭到不同程度的损害甚至彻底消失，但这座站点仍然保存了下来，成为历史的见证者。