主角吴邪（由侯明昊扮演），作为老九门吴家的传人，在经历了复杂险象环生的“七星鲁王宫”挑战并度过生死危机后平安脱困而归。回到家才得知其父吴三省（姚橹饰演）行踪杳无，于是他被牵涉进了一桩发生在十年前的一支考古队遗留下来的未解之谜中。根据来自匿名联络人的信息——此人名为阿宁，吴邪决定踏上寻找父亲的秘密之旅，目的地是他乡异国之地——西沙群岛一艘废弃已久的明朝古船遗址。就在那里，吴邪意外重逢昔日伙伴王胖子（张博宇饰演）。在这一系列冒险经历中，吴邪发现了一个奇特的物品—一条具有神秘面目的铜质鱼类雕塑；与此同时，一个叫做张起灵（成毅饰）且身份可疑的记忆丧失人士亦加入了他们的行列；一些推测认为，“小哥”的出现背后可能另有不可告人的原因。穿过阴森恐怖的地穴迷宫期间，他们遭遇到了各种可怕的海底怪物如海妖以及其它未知的威胁性生命体攻击，然而凭借着聪明才智解开了一系列重重禁制，最终逃至地表的安全地带。紧接着跟随最新获得的新线索指引，向着秦岭腹地挺进，揭开隐藏于巨大青云神树后的真相成为了亟待解决的任务。