本季是关于重新回到医院工作的牧野医生以及新初中的学生们的新篇章故事。尽管藤野一希在中学生活中难以适应，并且由于父亲突然带回家一个新伴侣和他的妹妺而感觉失去家庭的温暖；与此同时，虽然冴岛直明已顺利完成心脏手术并且升入高年级，他也怀着成为如牧野般优秀医生的决心，内心却充满不确定性。在这个时候，一名因病况加剧而彻底放弃生存希望的女孩进入了牧野的视野。除延续原有剧情外，这一季度还会新增加若干全新角色及其背景故事。