2010年秋，世界衛生組織官員小林榮子（檀麗 Rei Dan 飾）及隊伍前往菲律賓處理禽流感，雖然疫情很快被遏制，但仍有部分病人秘密逃出疫区……次年初，東京某公營醫院醫生松岡剛（妻夫木聰 Satoshi Tsumabuki 飾）接收一發熱症狀患者，其病情急轉直下致死，接著其家屬及其他醫療工作者亦感染受困。同期在鄰近農場检测到了禽流感病毒，致使雞場主人神蒼与其女（池肋千鶴 Chizuru Ikewaki 飾）生活颠簸不定。小林榮子獲委任指导防疫策略，并邀请老友松岡担任助手。疾病迅速扩散至一个月内导致两千人丧命，引起全民恐慌并受到国际关注，于是疫区被封锁起来。松冈偶然发现可能有其他源头传播病毒，并且国外送来的检查报告支持这一观点；随后他决定出国深入调查原因。随着疾病的肆虐，小林、松岡以及神蒼都面临各自的选择挑战。