在20世纪末那个夏天，人类认识到并非只有他们是地球上的力量。巨大的生命体“怪兽”及其终结者“哥斯拉”现身了。长达半个多世纪的对抗里，虽然屡战失利，人类仍成功撤离了这颗星球。到2048年，一艘名为“阿拉特拉姆”的太空船只搭载一群经AI挑选的人类前往远达11.9光年的目标地——“鲸鱼座τ星e”。然而，这批人的抵达时间推移后却发现，这个新世界的情况比预期更为严苛，根本不适合居留。在移民飞船上有一位叫晴雄的青年。在他四岁的时候亲眼目睹父母被哥斯拉吞食的画面深深植根于他心中。自此以后，他梦寐以求的是收复旧山河、战胜哥斯拉。随着时间流逝，重返地球的可能性愈发微乎其微，同时飞船内环境也日渐恶化。“重返地球”的呼声日益高涨，人们决定通过危险漫长的空间跳跃回到家乡。经过数万年后，现在的地球已是一片满布奇幻氛围之地，而哥斯拉已成为生态链顶端的重要角色之一。在这个未知又充满挑战的世界面前，这些生还者将何去何从？人类能否再次主宰这片土地？所有这些问题都将在未来的旅途中找到答案。