在这世界上，怪物成为了普通的威胁。日比野卡夫卡曾希望加入“日本防卫队”，却最终放弃了自己的愿望，在一家怪物清除公司找到了立足之地。他的朋友亚白米娜已经成为第三部队的大队长，展现出了她的能力；而后他遇到了想要加入防卫队的新成员市川莱诺，为卡夫卡重拾旧梦提供了机会。