《黑蝴蝶》的故事发生在阳光灿烂的上世纪80年代中期。此时，已重归故里的女主人公齐琳（由刘敏涛扮演）发现家中一切都不复往日模样，她的旧居已被他人所占。经历了诸多艰难的选择之后，她重新踏入了一个充满挑战的生活轨道。在此期间，她与一名困惑而又略显稚嫩的年轻男子周鲲鹏（由李家成饰演）建立了微妙的感情联系，两人虽素未谋面但却互相吸引，在一起探寻人生意义的过程中逐渐产生了深厚的情谊。但由于他们之间的巨大年龄差异让这段感情更加复杂和尴尬，当他们都深深沉醉在这种错综复杂的情绪时，那段久远的监狱记忆犹如突袭的暴风雨般打乱了一切，使这两颗心爱对方的灵魂必须跨越生与死的距离展开一次令人心碎的精神交。