刚集结的克隆人姊妹面临新的威胁。在Sarah和她的同伴揭露暗黑的Dyad研究所之后，她们发现了名为“Castor计划”的军事情报行动，“Castor计划”正在秘密培养一群顶尖男性克隆战士，在无情博士Coady的掌控下，这批克隆人拥有极高的专业度及杀伤力。但到底是谁孵化了这支军队，又有何目的？困守监狱、源自乌克兰且复员不久的孪生妹妹Helena内心的苦难日益加深；与此同时，Alison开启了一条既有效又极其危险的职业道路，而Cosima则解码了至关重要的基因序列密码—或许这将挽救所有人的命运。