在明成祖永乐年间，朱棣即位后积极治国数载，使得天下风调雨顺，连年丰稔，这是一段难得的安宁时光。平一姑（潘洁扮演）携同其子女寻常（孙耀威饰演）及浪荡子王九（李立群饰演），在京都漫游，靠简单的医药常识行骗为生。王九利用粗疏的医术夺走了寻常所钟情之人的躯体，并借由一名差役的支持设立了个人诊所以谋生存；随后寻常成为了他的主顾弟子，并收下了来自日本的新徒—竹野幸二（罗志敏饰演）。经过日积月累，王九对于室友盈不足（黄小燕饰演）萌发情感，不过他心底依旧挂念著逝去妻子玉蓉（张茜饰演）。另一方面，寻常偕同他人称作农草堂的人物（任泉饰演）共同参与了御用太医院举办的甄选考核并且成功过关，然而寻常仍怀念起以往过上逍遥日子的经历。因为受到了段天命（王群饰演）的压力缘故，平一姑并不愿意认同她与寻常之间的关联，殊不知其实寻常的真实身分是早前被错抱而失去了原生家庭的那个名医金农匮的孩子……。