山本大介身为主角，在幼年时因飞机失事流落至南美的亚马逊河流域，依靠自身力量存活下来，期间经受丛林磨砺锻炼出强壮体魄。现今，“基度”这个邪恶化集团意图利用古代印加文明遗迹实现世界霸权；在这样的背景下，被视作远古印加文化遗产守护人的巴哥长老对大介施行了一项特别手术，在他的左手腕部安装了神话传说中象征力量的神秘饰品—咕噜腕环，使他变身为拥有非凡能力的隐形斗士“蜥蜴改造人”，亦被称为“假面骑士亚玛逊”。其后，大介回到日本揭开自己身世之谜的同时也揭露由“十面鬼”主导、“基度”组织精心策划的一系列图谋与行动。