1962年，日浜湾。日军剿灭了一头庞大的异兽，青年古生物学专家本田浩博士解救出其一子嗣，并迅速将其一枚奇异的红卵送达美国俄亥俄州辛辛内提市（俄亥俄在日本指的是“你好”）。然而飞机降落之际，本田博士意外将卵投入卫生间马桶中。之后，那颗卵随着水流滑入俄亥俄河；与此同时，在这座城市地下五百多度的空间里，一个名叫SNUGI的秘密核研究中心正在进行有关“超裂变”能量的技术研发。SNUGI是由政府机关建立的一个隐蔽核力机构。