在未来的某个远古时代，地球环境恶化到不再适宜生存的状态下，人类转而开掘地底，并创造出了智能机器人作为劳力来源。可是，这些机器人为此发动起义，接管了地下的政权。因污染及新型病毒的影响，幸存人数已寥寥无几，又减少了近三分之一。借助基因工程技术得以长生不死，却丧失了生育能力，这使培育新人成为人类重振的关键所在之一。在这种情况下，“孕育”的遗传资料成为了亟需寻获的目标。因此，人类再度启程前往先前探访过、如今布满未知危险的地底下城市开展调查活动；同时期，面对学童骤降带来的歌舞教员岗位被削减的情境之下，仓库田也投身于这项深层的任务招募之中，化身为一名深入危机四伏地带寻求真相的开拓者。从此刻起，一段震撼人心的地底之旅即将展开序幕。