该故事情节发生在二战接近尾声时期，处于日军控制之下的中国上海。曾任日军“梅”特别机构长官的松田祯昭私自保留了一份代号为“蓝色档案”的长期卧底间谍名录。为了取得这份极其重要的文档资料，国共两党派遣精英特务深入敌方阵营进行行动：中共的情报人员赵康成功打入了梅机构内部；而隶属于军统部队的特工银狐和寒冰则是从重庆出发前往上海，执行他们的使命。尽管赵康牺牲了自己的荣誉和情感，在层层挑战之下赢得了松田的信任，并搜集到了不少至关重要的消息，但他并未高枕无忧——贪婪之心促使着银狐秘密帮助日本人传递情报，甚至还数度试图栽赃陷害赵康以自保。与此同时，来自美方的秘密代理人逢天爵正筹划利用获得武器的方式煽动中国国内各政治力量之间的矛盾冲突。得知这一情况后的党中央果断指示地下党员贺德彪及他的亲密战友兼同事沈亚奇假扮成另一支安全部门成员，在这座城市内展开了激流勇进般的生死保卫战来守护住那份关乎命运转折的关键性“蓝色档案”。不过由于两人相识初期互相保持着谨慎态度直到一次惊人的表现才彻底解除了双方的心防壁垒从而错失了捕捉背叛者银狐的最佳时机，因此最终导致赵康陷入了被怀疑的风险当中。另外，随着党组织的信息网逐渐瓦解使得一系列严重的后果接踵而来，其中更有甚者不惜投靠至敌对阵营泄露机密给侵略者施压，进一步加剧了局面的紧张程度。在这种局势愈发复杂的背景下，毫无头绪的沈亚奇遵照上级指令采取进攻手段误伤了无辜的盟友即真正的卧底英雄赵康，造成了一系列本可避免的悲剧收场。临近抗战胜利前夕，为了巩固自身利益优势，国民党委任具备卓越外事能力的新星沈亚奇担任地方上的大行行长一职负责处理当地经济发展事宜。稍后，军统再度下达紧急联络令要求铁腕型女领导者银狐携手同伴寒冰重新踏上征途清算过去累积下来的情感纠葛并追寻到最为真实无瑕的原始版本“蓝色档案”。而更深层次而言，“蓝色档案”的实际内涵远超表面所见它暴露出了一个隐秘于太平洋沿岸区域被称为黄金百合会的大规模犯罪团体藏身之所。这个至今鲜为人知的庞大非法收入来源其实是经过长时间东南亚市场黑幕交易所积累起的各种珍贵金属珠宝以及各类艺术珍品等等有价值的财产。恰在此时正当这场围绕核心机密文件的核心竞争进入最激烈阶段之时身为当局者的松田便施展手腕不断制造纷扰最终葬送掉之前费尽心思所积攒下来的成就进展。就在众人认为一切已然陷入混乱不堪的局面之时幸运的是细心聪慧的贺德彪意外发现了那枚刻印著伪造对比标识的小刀巧妙地将其带离险境转交进了新生政权的手上从而逆转乾坤化解了一场潜在的重大危机。