《命运石之门第二季》里，主人公冈部伦太郎历经重重困难，在绝望的时间线中放弃挽救“她”的尝试。极度失望的冈部伦太郎被“囚禁”，而“凤凰院凶真”也受到限制。“他”始终惦记着伙伴的安全。新增的角色带来了新的篇章，“0”的故事将要开始。确实，那边依然有“她”的身影——。