高町奈叶（由田村由香里配音）是一名普通的高中生三年级学生。一天，在她在上学的路上遇见了来自另一世界的梅德尔迦利王国的乌努（水桥香织配音）。乌努告诉她一个重要的机密：他在正试图找回散布于人世间的珍贵古代遗物——圣石之籽。这种独特宝石蕴含着巨大能量，如不慎被邪恶势力获得则可能导致整个世界毁灭。经历了一系列艰险之后，奈叶终于成为协助乌鲁尼找到种子的女巫，并开启这段充满挑战和惊险的冒险之旅。有一天，另一位名为菲塔（水树奈奈配音）的金色长发少女突然出现在奈叶面前。同样是搜寻同一样种的人造术者这意味着二人实质上是竞争对手关系。奈叶能否战胜这位强大的敌人呢？从菲娅的眼睛看去，这位温柔且坚韧的女孩究竟有什么特别的地方呢。