在新世纪的开端，科技取得了史无前例的进步，人体克隆和跨星系航行已成为实际应用的技术而非梦想。尽管如此，许多学者仍不懈追求解开人类起源的谜团。基于多种古文明的研究并进行对比性探讨后，两名研究人员伊莉莎白·肖博士（饰演：娜欧蜜·华拉）和查理·霍鲁威教授（饰演：洛克森·马歇尔-格林）提出了一种理论——人类可能是来自一个远距离星球的生命体创造的一种外星物种。获得维尔南公司资助之后，他们乘坐该公司所属的大型宇宙飞船“普罗米修斯”号出发前往探秘。经过现场考察确认，这一假说逐渐得到印证。不过，仓促揭开那些所谓的“神”的遗世秘密却酿成了无法弥补的结果。