该剧以抗战为背景，讲述了发生在白洋淀雁翎队的事迹，同样，《兵张嘎》也有关于这些地区的叙述。然而，《水上游击队》核心角色包括游击队队长魏光明及其副队长丁水妹，而嘎哈只是作为次要角色出现了一段时间。从现代价值观的角度来看，把孩子放在战场上明显违背道德准则。实际上发生的战事极其残忍、单一且充满恐怖与混沌，远远超出了艺术作品所能描绘的情节波澜壮致或悬念迭起的程度。为了增强观众的感受力，情节中的正义方与邪恶之间的力量差距被大大夸大，整部影片设计充满了不确定性以及激烈的戏剧性，有人认为其叙事方式类似一些美国电视剧风格。此外，在制作过程还有存在一定的私人的动机——力求精准再现当时的实况并未刻意贬低日军的形象而是试图公正表达共产党与"平型关大捷"及"百团大战"等战斗的关系同时突显国民政府在整个抗日时期的关键作用；特别布置了一名前国民党少校加入了雁翎队担任教练一。