在日本，大约每年会有二十万例未明死因的尸体出现，其中仅有一小部分会进行法医学尸检。为了改善这种状况，厚生劳动省领导组建了一个能够提出指导和决定是否进行尸检的专业医疗检验小组—MEJ（Medical Examiner Japan）。在美国经历过的杰出法医师水泽真澄（由藤冈靛饰演），曾经处理过许多验尸案例；尽管他的个性另类但十分精准且不受常规限制，常常质疑并探究问题的核心，“这里有所矛盾”。在他眼中，每位逝者的亲人都是特别的存在，他会仔细观察每一处细节，重构死者生前所经过的时间以及那些未曾公开的事实。而与之合作的是来自MEJ中心主任桐生麻帆（由泷内公美饰演）。成长于单亲家庭中的她是希望通过政策改革来推动社会进步，但她发现自己的理想并未获得体制内部的支持或认可。作为临时接替主任职责的人选，即使缺乏医学专业知识，她在解决各种谜团的过程中也逐步了解到“未知原因”的深层含义，并勇敢地对抗着种种挑战。他们二人虽然有着完全相反的态度和个人信念，但是在争辩、摸索过程中共同应对复杂的事件，并最终揭示隐藏在每一起看似平常死亡之后的真实故事。