在1997年，靳铁生博士（由刘德华饰演），是联合国选出的十名"未来领导者"之一，在一场谋杀案中成为焦点人物。几位即将领导未来的高层人士陆续死亡之时，香港突发性地丧失了通讯功能，随后出现了多例致命人体爆炸事件。然而，为了确保其人身安全，警察为他安排了严格的安保程序。但面对巨大的悲恸—刚刚失去女友阿黛尔（李嘉欣饰），他拒绝英国对外事务局的情报支持，选择了信任老同学兼旧日挚友焦大鹏（黄秋生饰）来担任他的保镖。随着调查进展，负责该案的工作人员开始锁定若干嫌疑人并采取行动消除他们存在的危险因素。不过随之而来的新问题是，已经过世很久的阿黛尔却通过倪太太给了他们一个重要线索—她提及了一个被严格保密的身份及其住所地址后便神秘失踪。另外，警方还攻破了一家日本公司信息系统，获取了一些关键信息指向幕后黑手正在进行的一系列活动都围绕不同宗教对末日预言的研究展开。更令人意想不到的是，当这对组合面临种种困惑时，再次出现的阿黛尔赠予他们两张前往布拉格的机票，暗示那里可能是解开所有谜题的答案所在。