《无主之战》描绘了明代中叶因内阁及东厂施压下，帝王无力有效执政的局面。故事围绕着由 东厂监正张鲸领衔的一些太监与以内阁首席王佐为头目的文官阶层争夺权柄而展开了争斗。锦衣卫统领赵崇禧身处两方立场坚定且忠实于皇上，并在队伍内坚持忠诚于的态度。然而，这支部队已然出现了裂痕，在各分支中有不少隐藏的情报双面人。看似南北地方守备机构间的对抗实则背后是太监与朝臣关于权利的较量。