在一片宁静的村子里居住着一位被称为尤教授的秘密人士，他融合科学实验与甜味剂、调味品及其他美妙元素，并加入一种被称作“X”的奇异黑色物质，成功创造了三个拥有特殊能力的女孩：分别是叫做泡泡、毛毛和花花的孩子们。泡泡的性格最为纯真开朗；相比之下，毛毛更为暴躁易怒；而花花天生具有领袖才能并且擅长阐述她的想法。这三个孩子互相支持，有必要时共同合作，组成一支专为抵御黑暗力量、捍卫公平正直的精神团队：“飞天小女警”。此外，村子还设有一条专用电话线供村民们呼叫这群超级英雄予以援助。“飞天小女警”的核心任务就是凭借才智与力量击败各种敌人。每当故乡面临威胁之际，“飞天小女警”都会毅然站出来，用强大的女性之力守护家园安宁以及全体村民的人身安全。