极右分子在一教会内部散布了一种细菌，导致俄罗斯东方的一个大城市完全消亡。类似的情况正在危及日本一座城市的安全，当地警方便邀集了仅18岁的天才黑客高中学生高木藤丸（饰演者为三浦春马），协助处理这一紧急状况。藤丸的父亲曾是名警探，并且作为主要调查人参与其中；但在误判一起案件后被定罪而逃离追捕。另有一位代号折原麻弥的秘密特工兼生物老师则隐蔽于该市学校内执行监视任务。为了保全妹妹小瑶的生命安全，藤丸无奈接受了非法获取电厂职员账户的任务来帮助反动组织。一次事件发生在巨型购物中心时发现可疑小丑散播有关“blood-x”毒病毒的信息引发了全民恐惧，警方虽尽力控制但人们几乎面临绝境。幸亏因藤丸迅速决策和平稳处置最终成功遏制住疫情蔓延未酿成惨剧。正当所有人都暂时安心之时，恐怖的真实面纱已然缓缓揭起。“Blood Monday”，成了每个遇难者生前最后的话语——这不仅是字面上的意义更藏着所有暗涌与争斗的关键。