波妞，海神之女，在探查陆地之际被囚禁在一艘漂到岸边的玻璃瓶内，正好让住在靠近悬崖的小宗介发现并将其营救出来，两人因此相识成为朋友。尽管她的父亲——巫师藤木因其厌恶这个世界的肮脏而坚决要送她回到海底，她仍然决定不顾一切变成人并与小宗介共度一生。同时，一直忠诚保护着波妞的小宗介也必须面对新的挑战。