忍术决战再次上演。始于崇德年间的三代将军继位之争，最后成为甲贺、伊贺两家忍者的激斗，直到达到悲剧顶点。当这一切归于平静之时，在这梦幻般的景色里，因为感情萌芽而产生的男男女女也悄悄离开了舞台。但透过服部半藏养子响八郎的消息得知，两位从两片新生花瓣中复活的生存下来的人是：甲贺八郎与伊贺响。他们都继承了父母特殊的眼眸，注定诞生于此世。进入宽永时期后，随着和平的到来，忍者变得不再必要，只有隐身才能活命。为了用血缘和实力为将来打下基础，甲贺与伊贺两家都将期望寄托在这对兄弟能人身上。“契约”虽然他们是同父异母的兄弟，但仍必须承担这一命运之约定。被命运漩涡束缚并奋力自救的是八郎；而由心底真诚的情感催生下来的，则是响。他们的生活路径编织成一条未知的路途，“樱”的奇特景象首次显现，并伴随动荡时局的身影渐渐临近。