夜幕降临，东都大学附属医院收治了一位无名伤者，其头部受创严重。由南仁大夫（大泽隆夫饰演）主持抢救，成功完成治疗任务。但此病人术后自行离去，使南仁追踪至楼梯处跌倒昏迷。待苏醒之际，发现置身于茂密丛林，恰好目睹一场激战中的剑客对峙。起初误认为是观看古装电视剧，幸好有年轻武士橘恭太郎相助方才获救。随后两人返回橘家宅第，并在那里迅速进行急救处理。此次救援让恭太郎的小妹橘喰深受震动，从此对其产生浓烈兴趣。次日上午，喰向他表示惊人消息——实际上他是抵达了德川时代的江户城！随着时间流逝，南仁的人生充满起伏变化。剧情核心围绕着他在此地传统药铺从业及后期创办私人家诊所的故事展开。期间众多重要角色相继出场，例如坂本龙马、胜海舟和绪方洪庵乃至新选组成员等人皆扮演着不同角色。此外，一位容貌极其酷似他的艺伎西風（由中谷美纪扮演）亦成为舞台焦点之一。面对这场奇幻经历，南仁不仅致力于将现代医术理念渗透进当时的制度框架内，还始终渴望改变无法逆转的时代进程。该作品基于著名日本女漫画作家村上的畅销原著改编，直至2011年底划上了圆满句点。