夜间，东都大学附属医院接纳了一名身份不明且遭受头部创伤的男子。负责主刀的是南仁大夫（大泽隆夫饰），他顺利完成救治工作。然而，这名病患在手术后擅自离开，导致南仁追赶中不慎从楼梯摔下晕了过去。等他再次醒来时发现自己身处一片森林之中，正目睹一场激烈的剑士对决。一开始以为自己正在观看一部历史剧集，幸亏遇到年轻的武士橘恭太郎才得以脱险。之后二人回到橘氏府邸，在那里进行了紧急医疗处置。这番救助令恭太郎的小妹橘喰深感震惊，自此对她产生了浓厚的兴趣。翌日早晨，喰告诉他一个惊世骇俗的消息：原来他已经穿越到了德川时期的江户！随着时间齿轮转动，南仁的生活也经历了诸多波折。整个故事主线集中在他在传统的草药店工作的日子及其后续开设私人诊所提供的故事情节上；剧中还有许多关键人物登场，包括坂本龙马、胜海舟、绪方洪庵甚至新选组队员。同时，也有另一位相貌极为相似的艺妓西風（演员中谷美紀）出现在舞台上。对于这一奇特的经历，南仁不仅努力将现代医学思想融入当时的社会结构之内，还一直试图干预不可阻挡的历史潮流。该剧以知名日本女性漫画作者村上的经典著作为基础创作而成，最终章节则在2011年播出完毕。